V CLILe na rozdiel od plánovania bežnej hodiny, je to práve obsah, ktorý zadáva požiadavky na jazyk a učitelia by s mali uistiť, že lingvisticky študenti rozumejú odbornej téme, ktorú práve vyučujú. Pochopenie tu zohráva dôležitejšiu úlohu ako pri tradičnej výučbe odborného predmetu. Stratégie ako skontrolovať toto pochopenie by malo byť včlenené do metodiky výučby daného predmetu. Tieto stratégie môžu využívať rôzne vizuálne metodické prístupy s dôrazom napr. na kľúčovú slovnú zásobu či ďalšie jazykové aspekty, alebo na rozšírenie opakovania (Deller a Price, 2011). Plánovanie hodiny v CLILe je pre učiteľov odborných predmetov vo vyššom vzdelávaní náročnou úlohou, keďže sa od nich žiada, aby dodržiavali princípy nielen ich vlastnej odborovej didaktiky, ale dokázali pri príprave svojej hodiny aplikovať aj didaktiku anglického jazyka Spolu s metódou CLIL. Rovnaké by mali spĺňať kritériá požadovaného formátu, v ktorom svoj predmet učia (laboratórne cvičenia, prednášky, semináre).