W porównaniu do standardowego planowania lekcji, w CLIL treści przedmiotu narzucają potrzeby językowe, a nauczyciele muszą upewnić się, czy studenci są w stanie zrozumieć program nauczania na będąc na danym poziomie języka obcego.
Planowanie lekcji z zakresu CLIL to trudne i wymagające zajęcie dla nauczycieli akademickich, którzy są zobowiązani do przestrzegania zasad dotyczących nie tylko ich własnej dydaktyki przedmiotu, lecz także do jednoczesnego zastosowania dydaktyki języka angielskiego i zasad podejścia do CLIL podczas przygotowywania zajęć dla studentów
